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沙冬青干旱胁迫响应的转录组学特征 | |
其他题名 | Drought-response transcriptome of ammopiptanthus mongolicus |
苏彦华 | |
数据提供者 | 苏彦华; |
发布日期 | 2020 |
维护机构 | 国家青藏高原科学数据中心 |
中文关键词 | 转录组测序 基因 沙冬青 差异表达分析 |
中文简介 | 通过Hiseq2000对沙冬青叶片和根系进行高通量转录组测序,发现了44959个unigene。并通过数据库比对,对其中的43192个unigene进行功能注释。发现干旱处理下,在叶片和根中差异表达的基因(表达量上调或下调2倍以上)分别有1035个和1210个。这些差异表达的基因集中于与物质运输、胁迫响应以及代谢过程,分子结构活性等方面。鉴定出干旱胁迫下差异表达的(专一性)响应基因40个。通过对沙冬青转录因子的分析,还发现沙冬青包含50个转录因子家族,1575个转录因子。在叶片中7个转录因子表达量上升,50个下降;在根中有11上升,33个下降。 |
空间范围 | 黑河流域 |
时间范围 | 2012 |
可获取性 | 离线申请 |
语种 | 中文 |
国家 | 中国 |
学科子类 | 生物地理学 |
文献类型 | 数据集 |
条目标识符 | http://gcip.llas.ac.cn/handle/2XKMVOVA/167846 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 苏彦华. 沙冬青干旱胁迫响应的转录组学特征.2020-01-01. |
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